Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PDGFRLQ15198 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PDGFRLQ15198 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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