Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAPTM4AQ15012 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms