Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PSMD6Q15008 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PSMD6Q15008 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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