Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NCAPHQ15003 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCAPHQ15003 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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