Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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KCNB1Q14721 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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KCNB1Q14721 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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KCNB1Q14721 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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KCNB1Q14721 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KCNB1Q14721 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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KCNB1Q14721 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNB1Q14721 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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KCNB1Q14721 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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KCNB1Q14721 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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