Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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GBX1Q14549 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GBX1Q14549 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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