Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM29Q14134 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM29Q14134 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms