Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DDX39BQ13838 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DDX39BQ13838 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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