Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RUNX3Q13761 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
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