Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ALCAMQ13740 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ALCAMQ13740 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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