Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC1Q13547 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC1Q13547 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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