Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATMQ13315 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATMQ13315 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATMQ13315 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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