Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIK3Q13003 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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