Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LRMPQ12912 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms