Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RAB40BQ12829 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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RAB40BQ12829 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RAB40BQ12829 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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RAB40BQ12829 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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