Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms