Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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GTF3C1Q12789 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF3C1Q12789 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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