Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SREBF2Q12772 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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