Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NUP160Q12769 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUP160Q12769 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms