Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM27E3Q08E93 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM27E3Q08E93 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms