Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACSM1Q08AH1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms