Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CD47Q08722 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD47Q08722 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD47Q08722 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD47Q08722 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms