Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR1Q08345 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DDR1Q08345 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR1Q08345 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms