Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR3Q06889 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms