Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC9Q06265 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EXOSC9Q06265 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms