Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms