Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP1P63208 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP1P63208 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP1P63208 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms