Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPS23P62266 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPS23P62266 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPS23P62266 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms