Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERVFC1P60507 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms