Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00313P59037 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00313P59037 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms