Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABP4P57796 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABP4P57796 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms