Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP107P57740 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms