Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIK1P57059 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SIK1P57059 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SIK1P57059 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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