Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP5P51878 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP5P51878 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP5P51878 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP5P51878 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP5P51878 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP5P51878 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms