Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF6P49848 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TAF6P49848 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TAF6P49848 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms