Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GSK3BP49841 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms