Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TTPAP49638 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TTPAP49638 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TTPAP49638 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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