Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRP9P49458 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRP9P49458 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRP9P49458 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms