Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CENPAP49450 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CENPAP49450 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CENPAP49450 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CENPAP49450 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CENPAP49450 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms