Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms