Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CRATP43155 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CRATP43155 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CRATP43155 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CRATP43155 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CRATP43155 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms