Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMPOP42166 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMPOP42166 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMPOP42166 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMPOP42166 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms