Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FDFT1P37268 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms