Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HPCAL1P37235 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms