Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LTBRP36941 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LTBRP36941 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LTBRP36941 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms