Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP7BP35670 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms