Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTN2P35609 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTN2P35609 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms