Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFTPDP35247 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms