Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GPC1P35052 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GPC1P35052 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms