Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NTF4P34130 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF4P34130 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms